无菌袋以其无菌、优良的耐低温性能，及良好的化学稳定性和电绝缘等性能，被广泛应用于无菌固体原料药、无菌药用辅料、无菌制剂等产品的转运和暂存，以及无菌胶塞从清洗到灌装线过程的中转包装。此外，在食品行业中，无菌袋还可以与纸板、铝箔共同组成食品的包装容器，其中无菌袋重量占整个包装的20%左右，主要阻隔液体渗漏和微生物侵袭的作用。